重慶市人民醫(yī)院（重慶大學(xué)附屬人民醫(yī)院、重慶市醫(yī)學(xué)科學(xué)院）是重慶市首批“國家三級甲等醫(yī)院”。經(jīng)重慶市政府批準(zhǔn)，由原重慶市第三人民醫(yī)院、重慶市中山醫(yī)院合并組建，于2016年3月25日掛牌成立。醫(yī)院有兩江院本部、三院院區(qū)、中山院區(qū)（重慶市眼耳鼻咽喉科醫(yī)院），以及獨(dú)立區(qū)域的健康管理中心。2022年1月，重慶市醫(yī)學(xué)科學(xué)院成立。2023年9月，成為重慶大學(xué)附屬醫(yī)院。

附屬腫瘤醫(yī)院創(chuàng)建于1943年，是集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、康復(fù)為一體的國家三級甲等腫瘤?？漆t(yī)院，是國際抗癌聯(lián)盟（UICC）成員單位，國家癌癥區(qū)域醫(yī)療中心委市共建單位，國家區(qū)域中醫(yī)（腫瘤）診療中心建設(shè)單位。

附屬三峽醫(yī)院地處三峽庫區(qū)腹心——重慶市萬州區(qū)，始建于1929年，2020年1月成為重慶大學(xué)附屬三峽醫(yī)院。是集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、保健為一體的、全國醫(yī)學(xué)學(xué)科設(shè)置最為齊全的大型綜合性三級甲等醫(yī)院，系全國文化醫(yī)院建設(shè)的引領(lǐng)者、全國醫(yī)院集團(tuán)化發(fā)展的先行者、重慶市級區(qū)域醫(yī)療中心。

附屬中心醫(yī)院是以急危重癥與創(chuàng)傷救治為特色，集120指揮調(diào)度、醫(yī)療、教學(xué)、科研為一體的國家三甲綜合教學(xué)醫(yī)院。面向社會提供醫(yī)療服務(wù)，履行政府公共衛(wèi)生救援及緊急醫(yī)學(xué)救援職能，承擔(dān)中心城區(qū)120指揮調(diào)度、日常急救任務(wù)。

附屬涪陵醫(yī)院建于1914年，2002年獲批國家三級甲等醫(yī)院，是集醫(yī)教研為一體的綜合性醫(yī)院，2022年3月正式獲批成為重慶大學(xué)直屬附屬醫(yī)院。醫(yī)院“一院三區(qū)”協(xié)同發(fā)展，總占地275畝，開放床位2200張，在崗職工2500余人。

附屬江津醫(yī)院始建于1939年，是一所集醫(yī)療、科研、教學(xué)、預(yù)防、保健、康復(fù)和醫(yī)學(xué)救援為一體的國家三級甲等綜合醫(yī)院，是重慶市首批公立醫(yī)院高質(zhì)量發(fā)展試點(diǎn)醫(yī)院。醫(yī)院設(shè)本部和東門分院，占地面積共220畝，編制床位1000張，承擔(dān)著江津及周邊地區(qū)500多萬人口的衛(wèi)生健康與疾病診治任務(wù)。

附屬黔江醫(yī)院是國家三級甲等綜合醫(yī)院，是市級區(qū)域醫(yī)療中心、國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地和醫(yī)師資格實(shí)踐技能考試基地。建筑面積21.8萬㎡，編制床位1500張，現(xiàn)有臨床醫(yī)技科室44個，重慶市重點(diǎn)（特色）學(xué)科、?？?7個。

重慶大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院（重慶市第五人民醫(yī)院）位于南濱路長嘉匯板塊，為三級甲等綜合醫(yī)院。建筑面積26.5萬平方米，規(guī)劃床位數(shù)1200張?，F(xiàn)有職工1300余人，博士40余人，碩士260余人，高級職稱240余人，其中正高70余人、副高160余人。

附屬沙坪壩醫(yī)院始建于1939年，前身是重慶市第六診所，歷經(jīng)80余年建設(shè)發(fā)展，現(xiàn)為一所集醫(yī)療、教學(xué)、科研、急救和保健為一體的國家三級綜合醫(yī)院（國家三級甲等教學(xué)綜合醫(yī)院創(chuàng)建工作已啟動），年門急診服務(wù)患者120萬余人次。